远程生物医学知识系统工程师（兼职，每周20小时）合同：12个月职位编号：36697593地点：完全远程（优先考虑美国候选人）时间安排：兼职 - 每周20小时职位简介
Sigma Systems正在寻找一位特别专业的生物医学知识系统工程师，以支持和现代化用于生物医学和监管研究的关键科学知识发现平台。
这是一个需要在生物医学信息学、临床试验数据、FDA监管系统、GenAI驱动的语义搜索和遗留系统现代化方面具备深厚专业知识的高级工程职位。理想的候选人应能够独立负责复杂系统的端到端管理，并在高度监管、数据密集的环境中独立工作。
主要职责遗留生物医学系统管理
- 独立管理、维护、重构和现代化定制的语义科学搜索平台
- 解决和增强具有复杂架构的遗留生物医学信息学应用
生物医学信息学管理
- 提供运营、管理和开发支持：
- 基因-疾病关联知识库
- FDA标签搜索系统
- 维护专业生物医学数据模型和工作流程的完整性
高级数据迁移与现代化
- 构建和执行复杂文档和向量数据库迁移
- 执行从MarkLogic到MongoDB的大规模迁移
- 确保完整的元数据保真度、可审计性和合规性
GenAI与语义知识发现
- 设计和实施GenAI驱动的应用程序：
- 语义科学搜索
- 自动知识提取
- 跨源生物医学数据综合
- 构建和管理LLM和代理框架、NLP管道和知识图谱
- 使用Vue.js（或同等工具）开发现代前端界面
监管与临床试验分析
- 领导临床试验结果的自动转换为符合FDA的提交模板
- 整合来自FDA、AACT和ClinicalTrials.gov的数据
云架构与安全
- 支持在AWS中的安全、合规部署
- 使用EC2、Elastic Beanstalk、Secrets Manager
- 就性能调优、互操作性和混合云最佳实践提供建议
必备资格（必须具备）
- 计算机科学、生物信息学、生物医学信息学或相关领域的学士学位
- 3年以上专注于：
- 生物医学软件开发
- 专业生物医学系统管理
- 必须具备MarkLogic和MongoDB的实际操作专业知识
- 包括两者之间的真实迁移经验
- 具有与FDA数据系统、AACT、ClinicalTrials.gov合作的经验
- 对FDA监管数据标准有深入了解
- 直接接触NLM生物医学数据源，包括：
- PubMed
- PubMed Central（PMC）
- 基因表达综合数据库（GEO）
- 生产级经验：
- NLP
- GenAI / LLMs
- 代理AI框架
- 语义搜索和知识图谱构建
- 全栈工程专业知识：
- 前端：Vue.js或类似
- 后端API和微服务
- 基于云的科学工作流程
- 在受监管环境中部署应用程序的经验
优先资格
- 之前拥有或管理定制构建的生物医学信息系统
- 支持或参与FDA监管平台的经验
- 涉及科学出版物分析或生物医学文献挖掘的工作经验
